Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTA1P02549 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms