Protein–RNA interactions for Protein: P01229

LHB, Lutropin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHBP01229 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHBP01229 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHBP01229 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHBP01229 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHBP01229 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHBP01229 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHBP01229 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHBP01229 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHBP01229 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHBP01229 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHBP01229 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHBP01229 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHBP01229 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHBP01229 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHBP01229 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LHBP01229 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHBP01229 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHBP01229 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHBP01229 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LHBP01229 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHBP01229 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms