Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM2O94769 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM2O94769 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM2O94769 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM2O94769 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM2O94769 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM2O94769 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM2O94769 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM2O94769 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM2O94769 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM2O94769 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM2O94769 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM2O94769 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM2O94769 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM2O94769 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM2O94769 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM2O94769 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM2O94769 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM2O94769 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM2O94769 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM2O94769 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM2O94769 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM2O94769 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM2O94769 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM2O94769 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM2O94769 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM2O94769 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM2O94769 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM2O94769 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM2O94769 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM2O94769 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM2O94769 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM2O94769 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM2O94769 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM2O94769 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM2O94769 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM2O94769 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM2O94769 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM2O94769 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM2O94769 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM2O94769 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM2O94769 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM2O94769 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM2O94769 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM2O94769 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM2O94769 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM2O94769 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM2O94769 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM2O94769 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM2O94769 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM2O94769 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM2O94769 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM2O94769 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM2O94769 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM2O94769 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM2O94769 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM2O94769 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM2O94769 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM2O94769 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM2O94769 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM2O94769 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM2O94769 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM2O94769 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM2O94769 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM2O94769 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM2O94769 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM2O94769 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM2O94769 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM2O94769 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM2O94769 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM2O94769 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM2O94769 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM2O94769 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM2O94769 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM2O94769 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM2O94769 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM2O94769 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM2O94769 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM2O94769 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM2O94769 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM2O94769 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM2O94769 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM2O94769 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM2O94769 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM2O94769 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM2O94769 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM2O94769 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM2O94769 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM2O94769 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM2O94769 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM2O94769 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM2O94769 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM2O94769 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM2O94769 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM2O94769 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM2O94769 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM2O94769 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM2O94769 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM2O94769 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM2O94769 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.9 ms