Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC45O75419 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC45O75419 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC45O75419 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC45O75419 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC45O75419 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC45O75419 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC45O75419 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC45O75419 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC45O75419 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC45O75419 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC45O75419 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC45O75419 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC45O75419 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC45O75419 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC45O75419 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC45O75419 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC45O75419 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC45O75419 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC45O75419 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC45O75419 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC45O75419 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC45O75419 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC45O75419 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC45O75419 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC45O75419 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC45O75419 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC45O75419 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC45O75419 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC45O75419 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC45O75419 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC45O75419 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC45O75419 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC45O75419 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC45O75419 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC45O75419 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC45O75419 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC45O75419 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC45O75419 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC45O75419 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC45O75419 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC45O75419 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC45O75419 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC45O75419 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC45O75419 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC45O75419 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC45O75419 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC45O75419 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC45O75419 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CDC45O75419 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC45O75419 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC45O75419 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC45O75419 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC45O75419 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC45O75419 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC45O75419 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC45O75419 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC45O75419 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC45O75419 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC45O75419 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC45O75419 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC45O75419 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC45O75419 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC45O75419 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC45O75419 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC45O75419 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC45O75419 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC45O75419 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC45O75419 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC45O75419 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC45O75419 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC45O75419 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC45O75419 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC45O75419 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms