Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms