Protein–RNA interactions for Protein: O60220

TIMM8A, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim8 A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM8AO60220 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM8AO60220 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms