Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA2O43921 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms