Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DENRO43583 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DENRO43583 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DENRO43583 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DENRO43583 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DENRO43583 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DENRO43583 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DENRO43583 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DENRO43583 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DENRO43583 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DENRO43583 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DENRO43583 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DENRO43583 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DENRO43583 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DENRO43583 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DENRO43583 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DENRO43583 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DENRO43583 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DENRO43583 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DENRO43583 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DENRO43583 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DENRO43583 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DENRO43583 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DENRO43583 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DENRO43583 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DENRO43583 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DENRO43583 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DENRO43583 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DENRO43583 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DENRO43583 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DENRO43583 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DENRO43583 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DENRO43583 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DENRO43583 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DENRO43583 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DENRO43583 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DENRO43583 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DENRO43583 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DENRO43583 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DENRO43583 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DENRO43583 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DENRO43583 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DENRO43583 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DENRO43583 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DENRO43583 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DENRO43583 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DENRO43583 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DENRO43583 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DENRO43583 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DENRO43583 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DENRO43583 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms