Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNMO15061 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNMO15061 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNMO15061 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNMO15061 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNMO15061 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNMO15061 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNMO15061 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNMO15061 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNMO15061 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNMO15061 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNMO15061 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNMO15061 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNMO15061 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNMO15061 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNMO15061 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNMO15061 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNMO15061 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNMO15061 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNMO15061 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNMO15061 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNMO15061 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNMO15061 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNMO15061 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNMO15061 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNMO15061 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNMO15061 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNMO15061 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNMO15061 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNMO15061 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNMO15061 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNMO15061 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNMO15061 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNMO15061 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNMO15061 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNMO15061 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNMO15061 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNMO15061 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNMO15061 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNMO15061 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNMO15061 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNMO15061 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNMO15061 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNMO15061 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNMO15061 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNMO15061 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNMO15061 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNMO15061 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNMO15061 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNMO15061 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNMO15061 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNMO15061 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNMO15061 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNMO15061 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNMO15061 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNMO15061 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNMO15061 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNMO15061 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNMO15061 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNMO15061 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNMO15061 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNMO15061 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNMO15061 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNMO15061 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNMO15061 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNMO15061 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNMO15061 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNMO15061 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNMO15061 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNMO15061 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNMO15061 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNMO15061 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNMO15061 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNMO15061 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNMO15061 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNMO15061 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNMO15061 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNMO15061 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNMO15061 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNMO15061 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNMO15061 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNMO15061 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNMO15061 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNMO15061 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNMO15061 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNMO15061 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNMO15061 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNMO15061 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNMO15061 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNMO15061 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNMO15061 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNMO15061 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNMO15061 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNMO15061 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNMO15061 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNMO15061 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNMO15061 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNMO15061 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNMO15061 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNMO15061 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms