Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms