Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APAF1O14727 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APAF1O14727 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APAF1O14727 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APAF1O14727 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APAF1O14727 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APAF1O14727 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APAF1O14727 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APAF1O14727 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APAF1O14727 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APAF1O14727 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APAF1O14727 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APAF1O14727 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APAF1O14727 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APAF1O14727 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
APAF1O14727 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APAF1O14727 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
APAF1O14727 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APAF1O14727 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APAF1O14727 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APAF1O14727 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APAF1O14727 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APAF1O14727 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APAF1O14727 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APAF1O14727 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APAF1O14727 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
APAF1O14727 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APAF1O14727 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APAF1O14727 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APAF1O14727 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APAF1O14727 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APAF1O14727 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APAF1O14727 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APAF1O14727 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APAF1O14727 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APAF1O14727 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APAF1O14727 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APAF1O14727 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APAF1O14727 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APAF1O14727 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APAF1O14727 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APAF1O14727 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
APAF1O14727 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APAF1O14727 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APAF1O14727 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
APAF1O14727 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APAF1O14727 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APAF1O14727 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APAF1O14727 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APAF1O14727 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APAF1O14727 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
APAF1O14727 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APAF1O14727 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APAF1O14727 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
APAF1O14727 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APAF1O14727 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APAF1O14727 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
APAF1O14727 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APAF1O14727 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APAF1O14727 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
APAF1O14727 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APAF1O14727 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
APAF1O14727 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APAF1O14727 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
APAF1O14727 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APAF1O14727 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APAF1O14727 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APAF1O14727 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APAF1O14727 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APAF1O14727 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APAF1O14727 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APAF1O14727 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APAF1O14727 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APAF1O14727 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APAF1O14727 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APAF1O14727 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APAF1O14727 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APAF1O14727 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APAF1O14727 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APAF1O14727 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APAF1O14727 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APAF1O14727 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APAF1O14727 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APAF1O14727 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APAF1O14727 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APAF1O14727 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APAF1O14727 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APAF1O14727 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APAF1O14727 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APAF1O14727 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APAF1O14727 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APAF1O14727 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
APAF1O14727 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APAF1O14727 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APAF1O14727 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APAF1O14727 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APAF1O14727 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APAF1O14727 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APAF1O14727 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APAF1O14727 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms