Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms