Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM247A6NEH6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms