Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms