Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 RPL36P1-201ENST00000419720 225 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 ZBTB21-203ENST00000398499 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 RABEP1-201ENST00000341923 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 SPARC-201ENST00000231061 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AC104964.2-201ENST00000562242 4641 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 L1TD1-201ENST00000498273 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 MAP9-201ENST00000311277 7333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 MEF2A-203ENST00000449277 5182 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 ZNF540-202ENST00000343599 3073 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 BRDT-205ENST00000399546 3357 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 TBC1D5-219ENST00000446818 3124 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 HMCN2-206ENST00000624552 15610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 ADGRB3-201ENST00000238918 2927 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 PHF21A-201ENST00000323180 3675 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 FTO-222ENST00000637969 2889 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 SLC16A4-210ENST00000541986 2496 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AC107884.1-207ENST00000504206 4433 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 MAPK10-281ENST00000641170 3070 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms