Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUL5

PHF23, PHD finger protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23Q9BUL5 ERC1-203ENST00000360905 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 AC126773.4-201ENST00000612545 3043 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 RPL7L1-208ENST00000493763 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 AL590682.1-201ENST00000437248 344 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 ZNF502-201ENST00000296091 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 OSGIN2-201ENST00000297438 4209 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 FASLG-202ENST00000367721 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 ADCY10P1-203ENST00000567255 4569 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 KLHL8-208ENST00000512111 3245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 CDK19-201ENST00000323817 6067 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 AP001803.1-201ENST00000525668 147 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 RN7SL178P-201ENST00000582930 304 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 KIF23-203ENST00000395392 3357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 CSMD1-206ENST00000520002 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 CSMD1-216ENST00000602557 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 IFIT2-202ENST00000611722 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 LY75-CD302-202ENST00000505052 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 EPHA4-201ENST00000281821 6346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 SZT2-210ENST00000634258 11045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 MYO5C-201ENST00000261839 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 ZNF484-203ENST00000395505 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 CYFIP2-221ENST00000618329 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 ANKS1B-211ENST00000547776 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 HOOK3-201ENST00000307602 14398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 HTR2C-202ENST00000371950 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 CYP27C1-201ENST00000335247 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 SLIT3-202ENST00000404867 8903 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 DIS3L2-202ENST00000325385 3501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 ZNF189-202ENST00000339664 3021 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 RN7SKP36-201ENST00000363997 312 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 OPALIN-203ENST00000393871 3545 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PHF23Q9BUL5 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.8 ms