Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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ZNF239Q16600 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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