Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms