Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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PTPRBP23467 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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PTPRBP23467 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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