Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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