Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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