Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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