Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms