Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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