Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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PTPRNQ16849 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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PTPRNQ16849 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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PTPRNQ16849 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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PTPRNQ16849 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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PTPRNQ16849 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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