Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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PKD2Q13563 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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PKD2Q13563 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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PKD2Q13563 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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PKD2Q13563 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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PKD2Q13563 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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PKD2Q13563 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
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