Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 Z99129.4-201ENST00000624649 2435 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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FOXC1Q12948 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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FOXC1Q12948 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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FOXC1Q12948 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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FOXC1Q12948 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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FOXC1Q12948 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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FOXC1Q12948 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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