Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms