Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RNF39Q9H2S5 F13A1-201ENST00000264870 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RNF39Q9H2S5 BTK-210ENST00000621635 2767 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RNF39Q9H2S5 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RNF39Q9H2S5 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RNF39Q9H2S5 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RNF39Q9H2S5 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RNF39Q9H2S5 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RNF39Q9H2S5 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RNF39Q9H2S5 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RNF39Q9H2S5 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RNF39Q9H2S5 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RNF39Q9H2S5 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RNF39Q9H2S5 ZNF502-204ENST00000449836 3173 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RNF39Q9H2S5 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RNF39Q9H2S5 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RNF39Q9H2S5 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RNF39Q9H2S5 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RNF39Q9H2S5 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RNF39Q9H2S5 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RNF39Q9H2S5 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RNF39Q9H2S5 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RNF39Q9H2S5 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RNF39Q9H2S5 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RNF39Q9H2S5 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RNF39Q9H2S5 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 STK32B-207ENST00000512636 3272 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 CACNA1D-201ENST00000288139 9341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 CCDC152-201ENST00000361970 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 PPARA-203ENST00000407236 9995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 FTO-222ENST00000637969 2889 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 ADGRE3-201ENST00000253673 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 KIF6-202ENST00000287152 9082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 C1orf87-201ENST00000371201 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 PLEKHG1-201ENST00000358517 7138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 SLC24A1-212ENST00000546330 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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