Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
GTF2H3Q13889 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GTF2H3Q13889 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GTF2H3Q13889 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms