Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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