Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 DDX11L10-201ENST00000430178 571 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC099344.1-201ENST00000433548 492 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01805-201ENST00000436433 572 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC008385.1-201ENST00000604421 355 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R1C-202ENST00000409137 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 CTSL3P-201ENST00000354530 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RNU1-16P-201ENST00000365477 164 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AL450124.1-201ENST00000376401 353 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA10B-201ENST00000384458 133 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC106869.1-202ENST00000441997 604 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 MRPS21P1-201ENST00000453850 223 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC087385.2-201ENST00000477729 498 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SL635P-201ENST00000492123 296 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC006070.1-201ENST00000508151 193 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC117383.2-201ENST00000514722 322 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC100823.2-201ENST00000518337 699 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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