Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIK3AP1-203ENST00000371110 3151 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 EZH1-201ENST00000415827 4608 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACNA1D-203ENST00000422281 6414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 GIGYF2-205ENST00000409547 5978 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRPM3-210ENST00000377111 4618 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBP-206ENST00000397863 4800 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF41-212ENST00000615206 5216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 PALM2-AKAP2-201ENST00000302798 4718 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 STAMBP-202ENST00000394070 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEMA5A-201ENST00000382496 11762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RUNX1T1-252ENST00000617740 7627 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 C7-201ENST00000313164 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ROBO2-201ENST00000332191 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRICKLE2-204ENST00000564377 8032 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 FRMD6-202ENST00000356218 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 CREB3L2-201ENST00000330387 7412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCC2-202ENST00000370449 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 FNDC3A-204ENST00000492622 6286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008467.1-201ENST00000512693 5471 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ESR1-206ENST00000427531 5436 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIF21A-204ENST00000544797 5040 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC107884.1-207ENST00000504206 4433 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RIPOR2-208ENST00000613507 5539 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 HPSE2-204ENST00000404542 3681 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms