Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 L3MBTL3-202ENST00000368136 4235 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 TACR1-201ENST00000305249 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 NLRP14-201ENST00000299481 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 FLT4-206ENST00000502649 4140 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 DHX37-206ENST00000544745 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 DIP2A-202ENST00000417564 6967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 DIS3L2-202ENST00000325385 3501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 GRK1-201ENST00000335678 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 MAMLD1-204ENST00000426613 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 CALML3-AS1-202ENST00000543008 4531 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 THBS3-211ENST00000541990 2928 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 OR9M1P-202ENST00000641564 3163 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 STXBP1-221ENST00000637953 3925 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 USP28-201ENST00000003302 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 MYOM1-203ENST00000400569 4927 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 TSC22D2-201ENST00000361875 11154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 LIG3-201ENST00000262327 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 C22orf46-201ENST00000402966 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 MXRA5-201ENST00000217939 9793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 RIPOR1-203ENST00000422602 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 NLRP12-203ENST00000391772 3205 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ITPR1-219ENST00000544951 4131 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDHA10-203ENST00000562220 12358 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA1671-201ENST00000358431 10490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 PPP6R3-201ENST00000265636 4794 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AP2A1-201ENST00000354293 3388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 CFAP45-202ENST00000426543 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 BMF-202ENST00000397573 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 STRADA-233ENST00000638888 1718 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ATXN1-202ENST00000436367 10587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AC083805.1-201ENST00000499481 3507 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 MST1R-202ENST00000344206 4198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 MBTD1-203ENST00000415868 5099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SORBS2-206ENST00000393528 3043 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 C11orf57-202ENST00000393047 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 IL22RA1-201ENST00000270800 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 NRXN3-202ENST00000335750 2764 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 TYW5-201ENST00000354611 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 CMC1-205ENST00000466830 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 LIFR-AS1-201ENST00000500733 3803 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SPACA6P-AS-201ENST00000602324 3962 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SEMA4A-204ENST00000368285 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 DDX3X-217ENST00000629496 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SLTM-202ENST00000380516 4147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ENDOU-202ENST00000422538 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 TUBB8-204ENST00000564130 2438 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 LUC7L3-208ENST00000505658 7040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 DNAH9-203ENST00000454412 13452 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 GRIA1-201ENST00000285900 5708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 DENND2C-202ENST00000393276 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ENPEP-201ENST00000265162 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ACACB-203ENST00000377854 6588 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 EYA1-202ENST00000340726 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 COL14A1-202ENST00000297848 6466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF106-203ENST00000565380 5677 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 PHF3-201ENST00000262043 8233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 GIGYF2-201ENST00000373563 5847 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms