Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms