Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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VPS72Q15906 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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