Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms