Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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TOP3AQ13472 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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