Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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LINC00587B1AMM8 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LINC00587B1AMM8 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
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LINC00587B1AMM8 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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LINC00587B1AMM8 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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LINC00587B1AMM8 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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