Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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FOXQ1Q9C009 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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FOXQ1Q9C009 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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