Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms