Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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