Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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