Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms