Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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CCDC6Q16204 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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