Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AP4S1-204ENST00000542754 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 RRN3-203ENST00000429751 2198 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 SGMS1-AS1-201ENST00000443374 12400 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 KLHL32-205ENST00000539200 3600 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 CEP128-209ENST00000555265 4662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC113608.1-201ENST00000398740 305 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC234782.3-201ENST00000461229 433 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 OR5BK1P-201ENST00000550421 823 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 MPP7-203ENST00000375732 5063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 PHF6-204ENST00000370803 4489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 PALLD-206ENST00000505667 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 ZNF268-213ENST00000542986 3773 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 CTNNA1-210ENST00000518825 3536 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 RBM7-204ENST00000541475 6725 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 REG3G-203ENST00000409471 575 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC068631.3-201ENST00000538831 225 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 MIR3137-201ENST00000577367 75 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AL137782.1-201ENST00000563635 4128 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 LRRC37A11P-201ENST00000425901 3580 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 MRPL22-206ENST00000522038 3162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 CYP2C8-211ENST00000539050 2024 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 CDH18-201ENST00000274170 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 DAZ4-203ENST00000382432 2405 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 DAZ2-205ENST00000382433 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 CTNND1-227ENST00000530748 5925 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 SPHKAP-202ENST00000392056 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 GOLGA8B-202ENST00000438958 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AL008638.6-201ENST00000623947 4254 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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