Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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