Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms