Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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ECM1Q16610 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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ECM1Q16610 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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ECM1Q16610 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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ECM1Q16610 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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ECM1Q16610 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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