Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNHIT3Q15649 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNHIT3Q15649 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNHIT3Q15649 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNHIT3Q15649 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNHIT3Q15649 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNHIT3Q15649 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNHIT3Q15649 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNHIT3Q15649 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNHIT3Q15649 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNHIT3Q15649 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNHIT3Q15649 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNHIT3Q15649 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNHIT3Q15649 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNHIT3Q15649 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNHIT3Q15649 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNHIT3Q15649 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
ZNHIT3Q15649 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNHIT3Q15649 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms