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| ZNHIT3 | Q15649 | RNA5SP341-201 | ENST00000516261 | 117 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
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| ZNHIT3 | Q15649 | RNU6-441P-201 | ENST00000384545 | 106 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | TRAV24-201 | ENST00000390453 | 343 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | TRAV34-201 | ENST00000390461 | 349 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
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| ZNHIT3 | Q15649 | SLC16A12-AS1-202 | ENST00000454270 | 478 nt | TSL 2 BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
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| ZNHIT3 | Q15649 | AC125611.2-201 | ENST00000551907 | 647 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
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| ZNHIT3 | Q15649 | AC012254.4-201 | ENST00000588843 | 273 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
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| ZNHIT3 | Q15649 | AC009570.1-201 | ENST00000609599 | 745 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
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| ZNHIT3 | Q15649 | AC096644.4-201 | ENST00000563417 | 2912 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | GABRG2-229 | ENST00000641017 | 3628 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC244517.1-201 | ENST00000606030 | 2086 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC091564.4-201 | ENST00000533934 | 2194 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | LPAR6-209 | ENST00000620633 | 2175 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC008505.1-204 | ENST00000637363 | 2714 nt | TSL 5 BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | TPTE2-202 | ENST00000382978 | 1677 nt | TSL 5 BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | TCF12-203 | ENST00000343827 | 3956 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | TOPORSLP1-203 | ENST00000493279 | 2871 nt | TSL 4 BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | IL21-201 | ENST00000264497 | 629 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RNU6-1027P-201 | ENST00000383998 | 107 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | MIR512-1-201 | ENST00000384913 | 84 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | OFD1P1Y-201 | ENST00000411756 | 1225 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | FNDC3CP-201 | ENST00000420795 | 1155 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RPL35AP12-201 | ENST00000425362 | 338 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AL035706.1-201 | ENST00000439186 | 683 nt | TSL 3 BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AL139230.1-201 | ENST00000440094 | 425 nt | TSL 3 BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC064874.1-202 | ENST00000440101 | 287 nt | TSL 3 BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | UBBP3-201 | ENST00000445497 | 241 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC004022.1-201 | ENST00000447766 | 1066 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | TEX41-209 | ENST00000451478 | 452 nt | TSL 2 BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | HMGN3P1-201 | ENST00000453847 | 193 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC096751.1-202 | ENST00000502691 | 1067 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |